Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb9Q9CQJ8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms