Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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