Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms