Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms