Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn6Q99PL6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms