Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nuf2Q99P69 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms