Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms