Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms