Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms