Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf17Q99MV7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms