Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms