Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SncaipQ99ME3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms