Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms