Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Sh3bp5lQ99LH9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Sh3bp5lQ99LH9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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