Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms