Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Higd1bQ99JY6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Higd1bQ99JY6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms