Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms