Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms