Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms