Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcdhga12Q91XY7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms