Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac11Q91WA3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms