Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps11Q91W86 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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