Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp3Q91W36 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms