Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce2Q91VT1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms