Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApofQ91V80 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ApofQ91V80 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms