Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenomQ8VHC3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms