Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms