Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Thoc3Q8VE80 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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