Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms