Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fyco1Q8VDC1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fyco1Q8VDC1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms