Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms