Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms