Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms