Protein–RNA interactions for Protein: Q8R043

Smim29, Uncharacterized protein SMIM29, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim29Q8R043 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim29Q8R043 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim29Q8R043 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms