Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MyripQ8K3I4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms