Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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