Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms