Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l2Q8JZQ2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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Afg3l2Q8JZQ2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Afg3l2Q8JZQ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms