Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LgsnQ8CIX8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms