Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms