Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap29Q8CGF1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms