Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms