Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Snx16Q8C080 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Snx16Q8C080 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Snx16Q8C080 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Snx16Q8C080 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Snx16Q8C080 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Snx16Q8C080 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx16Q8C080 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Snx16Q8C080 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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