Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh12Q8BYK4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms