Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV66

Ifi44, Interferon-induced protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44Q8BV66 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi44Q8BV66 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms