Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms