Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup54Q8BTS4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms