Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pbrm1Q8BSQ9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbrm1Q8BSQ9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms