Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy4Q8BQ47 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms