Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms